У 1859 р. з Одеси в Умань було переведено Головне училище садівництва, якому було передано парк «Софіївка» як навчальну базу. З 1859 р. розпочинається будівництво найстарішого навчального корпусу училища. Керівник будівництва – старший інженер Департаменту сільського господарства Микола Марков. У перші 3-4 роки було створено інші навчальні корпуси для класних занять, пансіонат для розміщення і проживання учнів, будинок директора, житла для викладачів, відремонтовано оранжереї.
У 1863 р. будується домовий храм Св. Марії Магдалини, що з'єднав навчальні корпуси та пансіонат у єдиний комплекс. У 1887 – 1890 рр. до церковного корпусу прибудовано тодішній головний корпус з надбудовою третього поверху у вигляді мезоніну. У 1908 - 1910 рр. ліворуч від входу у пансіон було прибудовано ще один прямокутний корпус, в якому розмістився пансіон на 125 осіб. Всі корпуси з'єднані наскрізними коридорами.
Споруда зазнала великих пошкоджень під час пожежі у січні 1944 р., вчиненій нацистськими окупантами.
Приміщення було відновлене повністю у 1952 р.
Вищий навчальний заклад за весь час свого існування мав такі назви :
- Головне училище садівництва (1844 – 1868)
- Уманське училище землеробства і садівництва (1868 -1903)
- Уманське училище садівництва і землеробства (1903 – 1921)
- Уманський агрополітехнікум (1921 -1929)
- Уманський сільськогосподарський інститут (1929 -1930)
- Уманський садово-городній інститут (1930 -1931)
- Уманський плодо-ягідний інститут (1931 -1934)
- Уманський плодо-овочевий інститут (1934 -1936)
- Уманський сільськогосподарський інститут (1936 -1996)
- Уманська сільськогосподарська академія (1996- 2000)
- Уманська державна аграрна академія (2000 -2003)
- Уманський державний аграрний університет (2003-2009)
- Уманський національний університет садівництва (з 2009)